Initialement formé à la flûte traversière au conservatoire de Toulouse pendant 8 ans en horaires aménagés, Thomas Koenig, se tourne ensuite vers le saxophone et les musiques improvisées.Apres cinq années en résidence dans les clubs salsa de Toulouse,il part à Boston étudier le jazz à la Berklee(Georges Garzone,Hal Crook)
Pendant ce séjour studieux, il enregistre avec Ambrose Akinmusire et plus tard avec Lonnie Plaxico et Dion Parson.Il rejoint le groupe Gonzalo Grau,La clave Secreta  qui ouvrira  notamment Los Van van au festival Benny Moré à Cuba
A son retour en France il s’installe à Paris,rentre dans l’équipe d’Aladji Touré et tourne avec plusieurs artistes camerounais(André Marie Tala,Laurent Evini »Zaky »)intègre des groupes de jazz comme les Pamplemousses sauvages créé par Florent Briqué (Leïla Martial,Federico Casagrande) Mitz(Julien Augier,Alex Terrier,Pascal Niggenkenper)et prend des cours d’écriture au Conservatoire du IX ème avec Pierre Bertrand à celui du X ème avec Jean Michel Bardez.
En dehors des concerts, il enseigne le jazz à La Clef à St Germain en Laye, anime des ateliers à l’institut Supérieur des Arts Afro-cubains et compose des musiques pour France Télévision.Il joue à Paris dans le quintet de Donald Devienne avec Tony Tixier,Gautier Garigue,fonde avec Gregoire Carpentier le groupe Edelweiss qui détourne la musique de Schubert,intègre le quartet de Rémy Gauche qui se produit tout d’abord avec Stephane Guillaume en invité régulier puis depuis 2018 avec Pierre de Bethmann.
Il participe à plusieurs concerts de l’Afrique enchantée et rejoint le quartet de Phillipe Monange Akrofo avec Youssouf Traoré aux percussions.
Depuis six ans Thomas est de nouveau à Toulouse, il fait partie du sextet de Sonny Troupé qui se produit régulièrement à l’étranger (festival de Fort de France, de Buenos Aires en novembre 2018,le festival Papjazz en Haïti en 2019)  Il compose avec Pascal Parent(tambours bata)une série de créations restituée au Deux pièces Cuisine(93) chaque année depuis 2017.
En Septembre 2020,il intègre le Kanazoe Orchestra avec Seydou Kanazoe et Laurent Planells.
Il s’implique dans la vie culturelle de sa ville en intégrant en Février 2020,le conseil d’administration de 3ème Face, collectif de jeunes musiciens toulousains.